環境保護的目的在減少環境中對人類生存健康不利的因素如疾病、毒物、空氣污染、噪音污染、垃圾堆臭氣…等，維護人類健康。
殺菌在環境保護中主要對象為病菌、微生物污染，預防疾病傳染，維護環境衛生，保護食品品質，藥物安全等；才能對人類健康有所保障。
一百多年前，大病無藥，傷口化膿，亦束手無策，因不知化膿為細菌感染引起。如今擦碘酒、紅藥水等就可安全無慮。
箘分真菌、細菌、病毒等：
- 真菌：即黴菌，在微生物中形体較大，如香菇…等，有需顯微鏡才能看清楚，如黃麴菌、香港腳的病原等。
- 細菌：形体更小，須高倍顯微鏡才能看見，如傷寒、霍亂、破傷風、結核、化膿等病的病原。
- 病毒：形体最小，須電子顯微鏡才能看見，如如AIDS，A、B型肝炎、流行性感冒、登革熱等病毒。
微生物需營養物質、適當水份、溫度才能繁殖，一般保持靜止、休眠、不動，時間久後自然死亡，或太陽中紫外線照射而死。部份微生物構造特殊，如細菌、真菌可產生孢子、對熱、乾燥、化學物質都有強抵抗性；部份細菌如結核病菌能產生夾膜，亦相當有抵抗性。微生物越多造成疾病力越強，抵抗力亦增加。
